【新冠病毒-Part 3】样本收集保存、处理、NGS测序…

 

在前期中,小艾为大家整理了【新冠病毒-Part 1】2019-nCoV 蛋白、抗体、试剂盒和【新冠病毒-Part 2】疫苗开发相关产品等部分内容,相信大家对这些内容已经有所了解了。那么如何对样本进行收集保存?如何进行样本核酸提取?以及如何进行NGS(二代测序或者高通量测序)?小艾将最近收集整理的病毒样本处理相关产品线分享给大家,希望对科研,研发,诊断的小伙伴们有所帮助,也需要大家帮忙分享传播~

 

产品线串联图谱总览:

【1】各类样本收集保存等相关产品:

 

分类 名称 货号 上样量 规格
血液 cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes 63950 8.4ml 50管
尿液 Urine Collection and Preservation Tube 5 cc 18116 1-5ml 1管
Urine Collection and Preservation Tube 5 cc (50 Units) 18118 1-5ml 50管
Urine Collection and Preservation Tube 15 cc 18120 5-15ml 1管
Urine Collection and Preservation Tube 15 cc (50 Units) 18122 5-15ml 50管
Urine Collection and Preservation Tube 50 cc 18111 5-45ml 1管
Urine Collection and Preservation Tube 50 cc (50 Units) 18113 5-45ml 50管
Urine Collection and Preservation Cup 120 cc 18129 100-120ml 1个
Urine Preservative Single Dose(尿液防腐剂) 18124 —— 单剂量
Urine Preservative Single Dose (50 Units)(尿液防腐剂) 18126 —— 50单位
唾液 Saliva DNA Collection and Preservation Devices (50) RU49000 2 mL 50次
Saliva RNA Collection and Preservation Devices RU53800 2 mL 50次
Saliva Exosome Collection and Preservation Kit 65400 2 mL 50次
Swab Collection and DNA Preservation System(采集鼻,颊,唾液,粪便,皮肤表面等样品DNA) 45690 —— 50次
粪便 Stool Nucleic Acid Collection and Preservation Tube 45630 2 g 1管
Stool Nucleic Acid Collection and Preservation Tubes 45660 2 g 50管
Stool Nucleic Acid Collection and Preservation System 63700 2 g 50次
Fecal DNA Collection & Preservation Mini Tubes 27650 ≤ 30 mg 12管
Fecal Swab Collection and Preservation System 45670 —— 50次

 

【2】样本中病毒核酸的提取和浓缩等:

 

分类 名称 货号
核酸提取 Viral DNA extraction kit(病毒DNA) K1446
96-well Viral DNA/RNA Kit(病毒DNA/RNA) K1417
Total RNA Purification Kit(总RNA) 17200,37500,17250
Total RNA Purification Plus Kit(总RNA) 48300,48400
Urine Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Midi Kit(尿液,中提) 60000
Urine Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Maxi Kit(尿液,中提) 60100
Urine Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Mini Kit(尿液,小提) 59900
Plasma/Serum Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Midi Kit(血浆/血清,中提) 56400
Plasma/Serum Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Mini Kit(血浆/血清,小提) 56300
Plasma/Serum Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Maxi Kit(血浆/血清,大提) 56500
病毒浓缩 PEG Virus Precipitation Kit(PEG病毒沉淀) K904

 

【3】NGS(二代测序)相关产品:

 

二代测序(NGS)可以同时给数以万计的DNA分子进行测序。这种可以多个样本同时测序的能力,在个性化医疗、遗传疾病和临床诊断等方面开创了革命性的领域。虽然不同的高通量测序机器生产时会在技术细节上有许多不同,但他们都有以下几个共同点:

 

  1. 文库建立:所有二代测序的平台都需要一个基因文库,这个基因文库包含通过引申或者连接自定义的接头序列。
  2. 测序仪器:每个文库片段在DNA连接因子的作用下,以文库适配序列为模版,在固体表面上进行扩增。这步扩增会产生许多DNA蔟,每个来源于一个文库片段,每个基因蔟都会像独立的测序反应一样起作用。
  3. 数据输出:每个仪器都会在测序结束后给出原始数据。这个原始数据是每个基因蔟中形成的DNA序列的集合。

 

不同的二代测序平台的区别主要体现在测序反应的技术上,这些差别可以分为4类:焦磷酸测序,合成法测序,连接法测序和离子半导体测序。

 

样本类型 分类 名称 货号

RNA样本
重亚硫酸盐转化 Methylamp RNA Bisulfite Conversion Kit P-9003
cDNA合成 EpiNext Hi-Fi cDNA Synthesis Kit P-9004
建库 EpiNext DNA Library Preparation Kit (Illumina) P-1051
EpiNext High-Sensitivity DNA Library Preparation Kit (Illumina) P-1053
NGS条形码 EpiNext NGS Barcode (Index) Set-12 P-1060
小RNA建库 Small RNA Library Prep Kit for Illumina 63610
Small RNA Library Prep Kit for Illumina (Indexes 1-24) 63600
Small RNA Library Prep Kit for Illumina (Indexes 25-48) 63620
文库定量 NGS Library Quantification Kit (for Small RNA-Seq) 61600
其它 NGS Normalization 96-Well Kit 61900
EpiNext 5-mC RNA Bisulfite-Seq Easy Kit (Illumina) P-9007
EpiNext RNA Bisulfite-Seq Kit (Illumina) P-9006

 

此外,艾美捷代理品牌Epigentek还有其它NGS方案:

 

  1. 5mC DNA Bisulfite Sequencing (重亚硫酸盐转化-建库-测序)

 

重亚硫酸盐转化-建库-测序

 

  1. MeDIP Sequencing (甲基化DNA免疫沉淀-建库-测序)

 

甲基化DNA免疫沉淀-建库-测序

 

  1. ChIP Sequencing (染色质免疫沉淀-建库-测序)

 

 

艾美捷独家代理品牌Norgen Biotek还提供NGS服务:

  1. 小RNA(microRNA)测序服务
  2. RNA(mRNA)测序服务
  3. 16S微生物组测序服务

主要服务流程为:1.咨询;2.样品提交/运输;3.样品分离;4. RNA质量控制;5.建库;6.测序;7.分析;8.最终报告。

 

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武汉加油,中国加油!

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