Image J新技能：生物膜图像分析

生物膜也称为生物被膜，是指附着于有生命或无生命物体表面被细菌胞外大分子包裹的有组织的细菌群体。生物膜细菌对抗生素和宿主免疫防御机制的抗性很强。生物膜中存在各种主要的生物大分子如蛋白质、多糖、DNA、RNA、肽聚糖、脂和磷脂等物质。生物膜的形成是一个动态的过程，包括细菌定殖阶段、集聚阶段、生物膜的成熟阶段和细菌的脱落与再定植阶段等四个阶段（如下图）。当浮游细菌与惰性物体表面或活性实体的表面接触后，浮游细菌会粘附到物体表面，启动在物体表面形成生物膜。

在研究原位生物膜的工具中，共聚焦显微镜（Confocal laser scanning microscopy,CLSM）是一种非常方便且好用的分析方法，如下列举的文章中，作者结合CLSM技术和图像处理软件，实现了对生物膜的展示和定量分析。

那么如何进一步分析得到这样的结果呢？

下面看运用Image J中的Comstat插件完成生物膜的分析

1、首先进入http://www.comstat.dk/界面

2、根据提示下载软件包，解压后点击Image J图标进入软件主界面，然后点击plugins-comstat2，调出分析窗口，在图1窗口中点击add按钮添加数据，图2中选择需要分析的数据，图3中勾选需要计算的参数，点击go开始计算。

3、在图4窗口中获得分析数据。同时，软件会将分析得到的数据以txt格式文件保存在源文件的文件夹中。这个软件计算的参数非常多，篇幅有限，小编就不一一说明了，如果感兴趣，可以参考comstat2软件包中的 “COMSTAT 2.1 MANUAL” pdf文档，里面有非常详细的说明。

图4.数据展示窗口，也是运行状态显示窗口.

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