科研热点:RNA甲基化研究必看高分文章

最新科研热点是什么?lncRNA、circRNA、肠道微生物、耐药基因CRISPR文库筛选、RNA甲基化、细胞焦亡、单细胞测序、高通量蛋白质组学等等都是如今研究得重点,但是今天要重点介绍得热点是RNA甲基化,简称m6A

 

为什么要介绍呢,因为一个月(5~6.10)就有数十篇高分文章online,涉及到植物、微生物、肿瘤、神经发育、干细胞等多个方向。

 

1. RNA N6-methyladenosine methyltransferase-like 3 promotes liver cancerprogression through YTHDF2-dependent posttranscriptional silencing of SOCS2.Hepatology. 2018 Jun

 

2. SUMOylation of the m6A-RNA methyltransferase METTL3 modulates its function. Nucleic Acids Res. 2018 Jun 1

 

3. RNA m6A methylation participates in regulation of postnatal development of the mouse cerebellum. Genome Biol. 2018 May 31

 

4. Ythdf2-mediated m6A mRNA clearance modulates neural development in mice. Genome Biol. 2018 May 31

 

5. Dynamic transcriptomic m6A decoration: writers, erasers, readers and functions in RNA metabolism. Cell Res. 2018 May 22(综述)

 

6. Base modifications affecting RNA polymerase and reverse transcriptase fidelity. Nucleic Acids Res. 2018 May 10

 

7. N6-Methyladenosine modification of lincRNA 1281 is critically required formESC differentiation potential. Nucleic Acids Res. 2018 May

.......

 

m6a-rna

 

m6A是一种动态可逆的修饰方式,在转录后调控中发挥作用,其在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA翻译等方面扮演重要角色。

 

国家自然科学基金是每一位科研工作者必选的目标,2018年国自然基金结果出来后,从随意统计的15项医学部基金结果:

 

 

从图中可以看出,面上项目九个,青年项目六个。肿瘤研究方向居多,占了12项。可见RNA甲基化这个热点已经在肿瘤这个领域悄悄兴起,童鞋们追热点课题,热不热,看肿瘤领域的情况就知道了。

 

2018国自然项目

生物钟基因BMAL1在人类胚胎干细胞分化中的作用及其mRNA甲基化的调控
piRNA调节m6A RNA甲基化参与MM发生发展的机制研究
RNA甲基化酶METTL14介导的lncRNA-m6A修饰在肝癌干细胞中的作用及机制研究
CDCP1 m6A RNA甲基化调控在膀胱癌发生发展中的作用及其机制
RNA甲基化m6A修饰位点变异与先天性心脏病遗传易感机制研究
m6A甲基化作用下的circHOOK3/miR558/ TGFβR1调控轴影响神经母细胞瘤发生、发展的作用机制
N6-Methyladenosine (m6A) 表观遗传修饰酶METTL3对食管癌的调控及机理研究
m6A甲基转移酶METTL3促进结直肠癌增殖转移的分子机制研究
香烟凝集物通过RNA-m6a甲基化修饰调控miRNA-25成熟在胰腺癌致病机制中的作用
TARBP2和m6A依赖的外泌体miRNAs筛选、鉴定及作为肝癌转移标志物的评价

 

国自然所有的RNA甲基化的项目,也就10项左右,m6A研究方向有干细胞分化、piRNA、lncRNA、易感基因、circRNA、肿瘤、miRNA的甲基化、外泌体miRNA等,可谓都是非常吸引人的项目,满打满算,现在收集一些样本或者细胞做一点MeRIP-seq,得到一些有意思的结果,相信这样的创新点一定会加分不少。

 

如果想选RNA甲基化作为方向设计课题,可以从哪些方面着手?

 

总体来看,以RNA甲基化修饰为主题的基金申请还是一个蓝海, 因此如果想选RNA甲基化修饰作为研究方向设计课题,可以从以下四种思路着手:

 

1. 研究RNA甲基化修饰过程中的参与者(Writer、Eraser和Reader)分子在疾病或者某一生命过程中的功能。比如:Mettl3介导m6A甲基化修饰调控慢性炎性疼痛机制研究。

 

2. 通过MeRIP–Seq/miCLIP等方法首先揭示疾病或者某一生命过程中RNA甲基化修饰的变化,即揭示疾病特异性m6ARNA甲基化图谱。

 

3. 揭示疾病或者某一生命过程中某一基因的特定RNA甲基化修饰与疾病的关系。即:RNA甲基化修饰——基因转录后调控(比如选择性剪接或者翻译,再或者microRNA的产生过程)——基因表达异常——疾病或者某一生命过程。

 

4. 鉴定参与RNA甲基化修饰的新分子,或者建立研究RNA甲基化修饰的新方法。

 

以上四种思路的研究难度是逐渐增加的,大家如果想选RNA甲基化修饰来作为研究方向,可以考虑逐渐增加难度,其中4建立新方法或者鉴定新分子可以说是科学家的工作了。

 

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