某些图像不能被识别怎么办？如何计算分子量和定量分析？如何查看和输出各种计算结果？等等问题在还没开始实验就困扰着你。实验做得好，软件不可少！今天小编为大家介绍一款凝胶分析软件- BandScan
它是一款通用的电泳胶条带定量分析软件。可以手动、自动找到条带，手动的条带可以是无规则的，可以清除背景。可以进行分子量、百分比、质量、波峰等方面的定量分析。并且直接使用扫描仪。可以将数据输出到excel文件。是一个很常用的凝胶图像分析软件，用它分析蛋白表达量。功能包括凝胶图像分析、光密度扫描、分子量计算、自动查找条带、杂点去除、电泳迁移校正功能。是一款非常好用的图像处理类生物软件。
BandScan 5.0软件下载：
链接：https://pan.baidu.com/s/1Bpb3gGPQrOGX9Gr4jrDTGA
提取码：9q5n
下面就以一个表达的一个蛋白图来示范这个软件分析的过程。最后结果是得到目的蛋白占总蛋白的百分数。
1、打开一张扫描好的电泳图。BandScan可以识别TIF和JPG格式的图片，很方便。打开工具栏上的file/open tiff，jpg file format，选中待分析的图片。
2、打开。这时候凝胶图像显示出来。1道是低分子量标准，2道是诱导表达的蛋白，3道是未诱导的对照。旁边有一个图像预览窗口Image Preview，可以看到，除了cancal，其它命令框都是灰色的（不可操作）。其实这里是要你先选定一个图像处理的范围（select rectangle）。
3、从凝胶图左上角按住鼠标左键划到右下角，松开鼠标，划出的长方形框包扩了整个待分析的范围。这时，命令框内均变成黑色的（可以操作）。上面那个undo rect可以取消选框，下面的image options可以选择是否和如何旋转图像。本例中均不改动，直接单击accept selected region。
4、出现color to signal selections复选框。这个是选择信号检测方式，直接用默认的original image，或选择gray scale（灰阶）。本例中不改动，单击use current image。
出现如下分析框。它是自动转换成灰阶的。其左上角的数字是鼠标所在的坐标和灰度值。移动鼠标就可以看到它的变化。
5、现在让BandScan来分析一下电泳条带吧：）打开工具栏上的band finding/find bands，出现一个让你选择有几条泳道的框selecting number of lanes，设置成3道。
6、当每一个条带都自动被框起来了：）红色+记号是条带的中心位置，兰色竖线是泳道位置。同时出现了一个复选框select more or select few bands。可以根据总灰度、最大灰度和大小为标准来自动选择蛋白条带。拉动左边的滚动条，可以增加或减少条带的数量。选好后单击ok。
7、现在就可以看看蛋白的表达量了。打开window/band table。出现了一个band location的表格。把它最大化，放到右边。这里的数据是每个条带的中心位置（红色+的位置）。
8、在band location的数据类型data type中，选择percent signal，就会出现各个条带灰度值占本泳道条带总灰度值的百分比。
9、单击自己的表达条带，则条带中心的+和相应的百分数的背景都会变成绿色。我表达的融合蛋白约占细菌总蛋白的29.8%。我们要的数据就得到了。
BandScan还有其他功能比如通过设定一个条带的量（标准）来推断表达蛋白的量、手动方式加入未被自动选择的条带等等，更多相关问题，欢迎大家留言讨论。
