2023年10月20日，来自美国冷泉港实验室Zachary B. Lippman等研究人员合作在学术期刊《科学》上发表了标题为“Idiosyncratic and dose-dependent epistasis drives variation in tomato fruit size. ”的研究成功，发现特殊和剂量依赖的上位性驱动番茄果实大小的变异。
据悉，基因间的上位性传统上是通过消除蛋白质活性的突变来研究的，但大多数天然遗传变异都是顺式调控DNA，并定量影响基因的表达和功能。
研究人员利用植物干细胞回路中的天然和工程顺式调节等位基因，系统地评估了控制番茄果实大小的上位性。结合一个启动子等位基因系列和另外两个基因位点，研究人员从46个基因型中收集了超过30000个表型数据点，从而量化等位基因强度如何改变上位性。研究人员发现了一种饱和剂量依赖关系，但也发现了等位基因特异性的相互作用，包括等位基因之间在驯化过程中驱动果实大小阶跃变化的相互作用。
这篇文章研究了对番茄果实大小具有影响的上位性相互作用。通过分析基因组中的调控位点，可以更好地理解番茄果实大小的遗传机制。这些方法和发现揭示了上位性中一个未被充分探索的层面，即基因调控网络中顺式调控等位基因的多样性会引起非线性、不可预测的相互作用，从而塑造表型。
文章来源：
Lyndsey Aguirre, Anat Hendelman et al, Idiosyncratic and dose-dependent epistasis drives variation in tomato fruit size.DOI: 10.1126/science.adi5222，Science：最新IF：63.714
