Nature Genetics:杂草和栽培高粱品种的基因组变异揭示农艺性状的遗传结构

2024年4月24日,来自中国农业大学Weibin Song团队于《自然—遗传学》杂志上发表了标题为“Genomic variation in weedy and cultivated broomcorn millet accessions uncovers the genetic architecture of agronomic traits.”的研究成果,通过研究分析杂草和栽培高粱品种的基因组变异,揭示了农艺性状的遗传结构

 

据介绍,大规模基因组变异是作物遗传育种的基础资源。

中国北方杂草和栽培种质的地理分布。

红点代表LR区域中的杂草种质;蓝绿色点代表YY区域中的杂草种质;

橙子点代表LP中的杂草种质;蓝色点代表栽培种质。

 

研究人员对1904个高粱基因组进行了平均40×测序深度的测序,并构建了杂草和栽培品种的综合变异图。作为最古老的栽培作物之一,高粱的核苷酸多样性极低,连锁不平衡衰减极快。全基因组关联研究确定了12个农艺性状的186个位点。许多致病候选基因,如决定粒径的PmGW8和决定穗形的PmLG1,在驯化过程中表现出强烈的选择特征。杂草品种含有许多有益的谷物性状变异,而这些变异在栽培品种中基本上消失了。杂草和栽培的高粱采用不同的位点控制开花时间,平行进行区域适应。

 

总之,这一研究揭示了高粱独特的群体基因组特征,为谷类作物提供了重要的农业资源。

文章来源:

Lu, Qiong, Zhao, Hainan, Zhang et al,  Genomic variation in weedy and cultivated broomcorn millet accessions uncovers the genetic architecture of agronomic traits.DOI: 10.1038/s41588-024-01718-6,Nature Genetics:最新IF:41.307

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