Nature:人类Y染色体完整序列问世

2023年8月23日,来自国立卫生研究院Adam M. Phillippy团队在《自然》杂志上发表了标题为“The complete sequence of a human Y chromosome. ”的研究成果,报道人类Y染色体的完整序列

2022年,最新版的人类参考基因组(T2T-CHM13)问世,包括所有22条常染色体和X染色体,含有30.55亿对碱基。这份参考基因组达到了前所未有的完整程度,解开了染色体着丝粒等结构复杂的区域。然而,人类参考基因组中的Y染色体,仍有一大半序列是缺失的

 

据了解,人类Y染色体的重复结构复杂,包括长回文、串联重复和节段重复,因此很难测序和组装。所以,GRCh38参考序列中缺失了一半以上的Y染色体,而且它仍然是人类最后完成的染色体。

 

 

端粒到端粒(Telomere-to-Telomere,T2T)联盟展示了来自HG002基因组的人类Y染色体62460029碱基对的完整序列(T2T-Y),该序列纠正了GRCh38-Y中的多个错误,并在参考序列的基础上增加了3000多万碱基对序列,显示了TSPY、DAZ和RBMY基因家族的完整扩增结构;41个额外的蛋白编码基因,其中大部分来自TSPY家族;以及异染色质Yq12区域中人类卫星1和3区块的交替模式。研究人员将T2T-Y与之前的CHM13基因组组装结合在一起,并绘制了可用的人群变异、临床变异和功能基因组学数据,从而为所有24条人类染色体提供了一个完整而全面的参考序列。

文章来源:

Rhie, Arang, Nurk, Sergey, Cechova et al,The complete sequence of a human Y chromosome. DOI: 10.1038/s41586-023-06457-y. Nature: 最新IF:69.504

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