生物评论周报第121期:Nature:CDK抑制剂CR8可降解细胞周期素K

 

1、Nature:CDK抑制剂CR8可作为分子胶水来降解细胞周期素K

 

2020年6月3日,来自美国哈佛大学Benjamin L. Ebert、瑞士弗里德里希·米舍尔生物医学研究所Nicolas H. Thomä等研究人员合作在《自然》上发表了题为“The CDK inhibitor CR8 acts as a molecular glue degrader that depletes cyclin K”的研究结果,发现CDK抑制剂CR8可作为分子胶水来降解细胞周期素K。

 

CDK抑制剂CR8可降解细胞周期素K

Fig 1| Cartoon representation of the crystal structure of DDB1(∆BPB)–(R)-CR8–CDK12–cyclin K. CTD, C-terminal domain.

 

通过系统地挖掘数据库来了解4,518个临床和临床前小分子的细胞毒性与数百种人类癌细胞系中E3连接酶成分表达水平之间的相关性,研究人员确定了CR8(一种细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的抑制剂)可作为分子胶水。CR8的CDK结合形式具有一个与溶剂接触的吡啶基部分,可诱导CDK12–细胞周期素K和CUL4衔接蛋白DDB1之间形成复合物,从而绕过了对底物受体的需求,并使得细胞周期素K被泛素化和降解。

 

这项研究表明,表面暴露部分的化学变化能够让抑制剂获得分子胶水的性能。因此,研究人员认为这将是一种更广泛的策略,从而将靶标结合分子转化为分子胶水。

 

据了解,分子胶水化合物诱导蛋白质间相互作用,在泛素连接酶作用下导致蛋白质降解。与传统的酶抑制剂不同,这些分子胶降解剂在化学计量上起催化作用,以快速消耗以前无法接近的靶标。它们在临床上有效且广受欢迎,但迄今为止只是偶然发现的。

 

(评论:抑制剂变“分子胶水”,降解皆有可能

 

文章来源:

Mikoaj Sabicki, Zuzanna Kozicka et al, The CDK inhibitor CR8 acts as a molecular glue degrader that depletes cyclin K, DOI: 10.1038/s41586-020-2374-x,Nature:《自然》,最新IF:43.07

 

2Nature Biotechnology:揭示细胞核染色质的放射状结构

 

2020年5月25日,来自瑞典卡罗林斯卡学院Magda Bienko、Nicola Crosetto等研究人员在《自然—生物技术》上发表了题为“GPSeq reveals the radial organization of chromatin in the cell nucleus.”的研究成果,合作利用GPSeq技术来揭示了细胞核中染色质的放射状结构。

 

银屑病的流行病学分析

fig. 2 | Generation of 3D genome structures by GPSeq and Hi-C integration.

 

研究人员报道了通过测序进行基因座定位的方法(GPSeq),这是一种全基因组方法,可推断整个核半径上与核纤层的距离。GPSeq依赖于从核纤层到核中心的染色质逐步限制性消化,然后对产生的切割位点进行测序。使用GPSeq,研究人员以100 kb的分辨率绘制了人类基因组的径向组织图谱,从而揭示了基因组和表观基因组特征与基因表达以及A和B亚区室的径向模式。

 

通过结合径向信息和Hi-C测量的染色体接触频率,研究人员大大提高了全基因组结构建模的准确性。最后,研究人员绘制了DNA双链断裂、生殖系变异和癌症突变的放射状拓扑图谱,并发现它们在A和B亚区室中具有独特的放射状排列。研究人员认为,GPSeq可以揭示基因组结构的基本信息。

 

据悉,除了与核纤层相关的结构域外,哺乳动物细胞中染色质的放射状组织在很大程度上仍未知。

 

评论:学习了

 

文章来源

Gabriele Girelli, Joaquin Custodio et al, GPSeq reveals the radial organization of chromatin in the cell nucleus, DOI: 10.1038/s41587-020-0519-y, Nature Biotechnology:最新IF:31.864

 

3BMJ : 全球范围内银屑病的流行病学分析

 

2020年5月28日,来自英国曼彻斯特大学Rosa Parisi团队在《英国医学杂志》上发表了题为“National, regional, and worldwide epidemiology of psoriasis: systematic analysis and modelling study . ”的研究结果,分析了国家/地区和全球范围内银屑病的流行病学。

 

为了系统回顾并提供有关银屑病发病率的信息,并对全球、国家/地区特定银屑病的流行率进行估计,研究组在Medline,Embase,科学引文索引等大型数据库中检索从建库到2019年10月的文献,筛选出报告一般人群银屑病发率或患病率的研究,并进行系统审查和荟萃分析。

 

银屑病的流行病学分析

Fig 3 | Lifetime (physician or dermatologist diagnosed) prevalence of psoriasis in adults by country. Details about countries with observed or extrapolated data are given in fig 1 and supplementary material 2 (eTables 6-11)

 

最终共有168项研究符合纳入标准。银屑病的患病率从东亚的0.14%到大洋洲的1.99%不等。西欧(1.92%)、中欧(1.83%)、北美(1.50%)和拉丁美洲南部高收入人群(1.10%)的银屑病患病率也很高。

 

总之,世界上有81%的国家缺乏有关银屑病流行病学的信息。该病在成年人中比在儿童中更常见。银屑病在各个地区分布不均;在高收入国家和人口较多的地区更为普遍。

 

评论:这可以整体了解到病情的分布情况

 

文章来源

Rosa Parisi, Ireny Y K Iskandar et al,  National, regional, and worldwide epidemiology of psoriasis: systematic analysis and modelling study. DOI: 10.1136/bmj.m1590 , BMJ : 最新IF:27.604

 

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