Nature Genetics:三倍体栽培香蕉基因组的起源与演化

2023年12月11日,来自浙江大学农业与生物技术学院Liangsheng Zhang,福建农林大学Peitao Lü,Zonghua Wang,云南省种子实验室Jihua Wang,华南农业大学Xiaofan Zhou,比利时根特大学和VIB植物系统生物学中心Yves Van de Peer共同合作在《自然—遗传学》杂志上发表了标题为“Origin and evolution of the triploid cultivated banana genome.”的研究成果,研究了三倍体栽培香蕉基因组的起源与演化

 

据介绍,大多数新鲜香蕉属于Cavendish和Gros Michel亚群。

香蕉

研究人员报道了报道了Cavendish (1.48 Gb)和Gros Michel (1.33 Gb)的染色体尺度基因组组装,定义了三个亚基因组,即Ban、Dh和Ze,它们的主要祖先分别是Musa acuminata ssp. banksiimalaccensiszebrina。在大多数二倍体和三倍体香蕉中,在尖孢镰刀菌Fusarium oxysporum f.sp.cubenseFoc)热带第4种族 RGA2(抗性基因类似物2)启动子中插入了重复序列。

 

研究人员发现包括Foc种族1抗性基因在内的受体样蛋白(RLP)位点在Gros Michel Ze亚基因组中缺失。研究人员发现了两个在果实中特异性高表达的 NAP(NAC-like,由 apetala3/pistillata 激活)转录因子同源物,它们直接与许多果实成熟基因的启动子结合,可能是果实成熟的关键调控因子。

 

总之,研究人员鉴定了新的调控果实成熟的关键基因(MaNAP4MaNAP5)。为香蕉的安全生产(抗枯萎病和提升果实品质)提供遗传操作靶点和理论指导,这一基因组数据应该有助于香蕉的育种和超级驯化

 

文章来源:

Li, Xiuxiu, Yu, Sheng, Cheng, Zhihao et al,  Origin and evolution of the triploid cultivated banana genome.DOI: 10.1038/s41588-023-01589-3. Nature Genetics:最新IF:41.307

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