1、Nature: 宿主变量混淆了人类疾病相关的肠道菌群研究
2020年11月4日，来自美国国立卫生研究院Yasmine Belkaid、Ivan Vujkovic-Cvijin等研究人员合作在《自然》杂志发表了题为“Host variables confound gut microbiota studies of human disease.”的研究结果，发现宿主变量混淆了人类疾病相关的肠道菌群研究。
研究人员推断了人类肠道微生物群谱最大、最普遍的异质性来源，并且还鉴定了人类的生活方式和生理特征，在这些因素中，如果病例与对照之间的差异不均等，则会混淆微生物群分析，从而产生与人类疾病相关的虚假微生物关联。研究人员将酒精摄入频率和排便质量确定为肠道菌群差异的强大来源，这些在健康参与者和患有疾病的参与者之间分布不同，并且可能混淆研究设计。
Fig 1|Human participants with a disease vary from healthy controls in critical microbiota-associated variables that confound microbiota analyses.
研究人员证明，对于许多流行的高负担人类疾病，实验组和对照组如果减少了这些混淆变量能够降低微生物群中观察到的差异和虚假关联的发生率。在此基础上，研究人员提供了一个人类变量列表，并建议在人类微生物群研究中获取这些宿主变量来匹配比较组，研究人员预计这些变量将在解析与人类疾病真正相关的肠道菌群成员时提高稳健性和可重复性。
微生物群在人类疾病中作用的研究存在很低的一致性，这限制了鉴定宿主相关微生物与病理之间因果关系的能力。微生物群组成中个体之间的广泛异质性加剧了获得假阳性的风险，这可能是由于人类生活方式和生理变量在人群中的差异造成了对微生物群的不同影响。
（评论：该研究提示我们对照组的选择会干扰微生物组研究的结果，并为当前微生物组关联研究难以解决发病机制的问题提供了潜在的解释。基于此，未来在开展微生物组研究时，研究人员或许应纳入更多因素，充分考虑宿主变量对肠道菌群的干扰。）
文章来源：
Ivan Vujkovic-Cvijin, Jack Sklar et al, Host variables confound gut microbiota studies of human disease. DOI: 10.1038/s41586-020-2881-9,Nature：最新IF：43.07
2、BMJ:孕期遭遇高温环境增加早产、低出生体重和死产的风险
2020年11月4日，来自南非金山大学Matthew Francis Chersich团队在《英国医学杂志》上发表了题为“Associations between high temperatures in pregnancy and risk of preterm birth, low birth weight, and stillbirths: systematic review and meta-analysis”的研究结果，研究了孕期遭遇高温环境与早产、低出生体重和死产风险的相关性。
为了评估怀孕期间遭遇高温环境是否与早产、低出生体重和死产的风险增加相关，研究组在Medline和Web of Science数据库检索2019年8月之前的文献，筛选出高温环境与早产、出生体重和死产之间关联的临床研究，并进行系统评价和随机效应荟萃分析。
研究组共筛选了14880条报告和175篇论文。共纳入70项研究，涉及27个国家/地区，其中7个是中低收入国家。在47项研究的40项中，较高温度环境下的早产率高于较低温度环境。暴露因素被划分为热浪、1℃增量和温度阈值截止点。
Fig 2 |来源BMJ
在随机效应荟萃分析中，温度每升高1°C，早产率增加1.05倍，热浪期间早产率增加1.16倍。在28项研究的18项中，温度升高与出生体重减轻有关，且统计上的异质性很高。8项关于死胎的研究均显示温度与死胎率相关，温度每升高1°C，死胎率就会增加1.05倍。在较低社会经济群体和年龄极小或极大的女性中，温度与妊娠不良结局的相关性最大。
（评论：随着全球变暖，气温上升可能对儿童健康产生重大影响。尤其在中低收入国家，风险可能最大。）
文章来源：
Matthew Francis Chersich, Minh Duc Pham et al, Associations between high temperatures in pregnancy and risk of preterm birth, low birth weight, and stillbirths: systematic review and meta-analysis. DOI: 10.1136/bmj.m3811.BMJ-British Medical Journal: 最新IF：27.604
2020年11月4日，来自美国纽约大学Claude Desplan、Nikolaos Konstantinides等研究人员合作在学术期刊《自然》上发表了题为“Neuronal diversity and convergence in a visual system developmental atlas.”的研究结果，绘制出果蝇视觉系统的发育图谱，并揭示神经元的多样性和趋同性。
Fig 3| Dorsal and ventral visual circuits are partitioned by differential Wnt signalling.
通过对果蝇视神经叶转录组多样性的完整描述，研究人员报道了对大脑发育的见解。研究人员在成年期和五个蛹阶段获得了275,000个单细胞的转录组，并建立了机器学习框架，可在开发过程中的所有时间点将它们分配给近200种细胞类型。研究人员发现了两大类神经元群体，它们在发育过程中包裹了神经毡，但是在成年前就死亡了，还有两类神经元亚型，它们通过整个发育过程中的Wnt差异信号来分隔背侧和腹侧视觉回路。
此外，研究人员表明，相同类型但间隔数天产生的神经元转录组在产生后不久就会同步。在突触发生过程中，研究人员还解析了神经元亚型，尽管其形态和连接性差异很大，但它们在成年人中趋同为难以区分的转录组谱。这个数据集几乎完全说明了果蝇视神经叶的已知神经元多样性，并可成为理解不同物种间大脑发育的范例。
据悉，解密如何建立和维持神经元多样性需要在整个发育过程中对神经元基因表达有详细的了解。与哺乳动物的大脑相反，果蝇视神经叶及其连接体具有大量神经元多样性，并已经几乎完全被表征。但是，缺乏这种神经元多样性的分子表征，特别是在发育过程中。
（评论：学习了）
文章来源：
Mehmet Neset zel, Flix Simon et al,Neuronal diversity and convergence in a visual system developmental atlas. DOI: 10.1038/s41586-020-2879-3, Nature：最新IF：43.07
