EpigenTek:组蛋白修饰全流程

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我们提供最全面的组蛋白修饰研究产品,涵盖实验流程的每一步,从上游到下游。

 

组蛋白是真核生物染色质的主要蛋白质成分,参与基因调控。H3和H4组蛋白的尾部从核小体中伸出,可以发生翻译后修饰,从而改变组蛋白与DNA和核蛋白的相互作用,导致表观遗传变化,调节许多正常和疾病相关的过程。EpiGentek提供了一系列完整的试剂盒,可用于定量H3组蛋白的甲基化、乙酰化和磷酸化修饰(参见我们提供的组蛋白修饰表格)。

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源文件下载:https://www.epigentek.com/docs/histonetable.pdf

 

组蛋白甲基化

组蛋白甲基化是一种表观遗传修饰,通过组蛋白甲基转移酶(HMTs)将甲基基团转移到组蛋白尾部(尤其是N端尾部)。组蛋白去甲基化则由组蛋白去甲基化酶(HDMs)催化,去除甲基基团。这两种修饰通过改变染色质结构调控基因表达。

组蛋白(H2A、H2B、H3、H4)构成染色质的基本单位——核小体。组蛋白甲基化或去甲基化可导致染色质紧缩(异染色质,转录不活跃)或松散(常染色质,转录活跃),从而调控基因表达。

甲基基团在组蛋白上的位置和数量决定染色质是否可用于转录。例如:

H4K20me1(组蛋白H4赖氨酸20单甲基化)导致染色质紧缩,抑制转录;

H3R17me1(组蛋白H3精氨酸17单甲基化)则激活转录。

赖氨酸甲基化既可激活(如H3K4、K36、K79)也可抑制(如H3K9、K27、H4K20)基因表达。

 

研究组蛋白甲基化和去甲基化有助于理解“组蛋白密码”及其对基因表达的调控机制。异常组蛋白修饰与癌症、自身免疫性疾病、炎症和神经性疾病等多种疾病相关。检测组蛋白修饰不仅揭示疾病表观遗传机制,还为开发靶向组蛋白修饰的药物提供了重要依据。

 

组蛋白乙酰化

组蛋白乙酰化是一种表观遗传修饰,通过在组蛋白N端尾部的赖氨酸残基上添加乙酰基团实现。这一过程由组蛋白乙酰转移酶(HATs)催化,HATs根据细胞内位置和组蛋白特异性分为细胞质和核两种类型。相反,组蛋白去乙酰化酶(HDACs)负责去除乙酰基团,称为组蛋白去乙酰化。
组蛋白乙酰化和去乙酰化通过调控染色质结构影响基因表达。乙酰化使染色质松散(常染色质),促进转录活性;去乙酰化则使染色质紧缩(异染色质),抑制转录活性。


HDACs分为四大类:

I类:HDAC1、HDAC2、HDAC3、HDAC8;

II类:HDAC4、HDAC5、HDAC6、HDAC7、HDAC9、HDAC10;

III类:SIRT1至SIRT7(依赖NAD?);

IV类:HDAC11。

分类依据是与酵母蛋白的同源性。


研究组蛋白乙酰化和去乙酰化有助于揭示“组蛋白密码”的机制,并为开发HDAC靶向药物提供基础。HDAC抑制剂(HDACi)已用于情绪稳定、抗癫痫、癌症治疗(特异性靶向肿瘤细胞)以及神经退行性和炎症性疾病的治疗。

 

组蛋白磷酸化

组蛋白磷酸化是一种翻译后修饰,影响丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸残基。它涉及向组蛋白尾部添加磷酸基团,可在染色质重塑中发挥作用。所有四种核小体组蛋白尾部都可能被磷酸化。组蛋白磷酸化的一个最著名功能是细胞对DNA损伤的响应。尽管已经发现了许多磷酸化位点,但新的位点仍在持续的表观遗传研究中被发现。

 

组蛋白研究步骤详细信息

 

1. 组蛋白提取

EpiQuik总组蛋白提取试剂盒可让研究人员可靠且便捷地从哺乳动物细胞或组织中分离组蛋白,仅需一小时。这些试剂盒推荐用于准备组蛋白提取物,用于EpiGentek的组蛋白修饰分析试剂盒或多种下游应用,包括组蛋白乙酰化、甲基化、磷酸化和SUMO化。

编号

名称

描述

OP-0006

EpiQuik总组蛋白提取试剂盒

用于分离具有翻译后修饰(PTMs)的组蛋白

OP-0007

EpiQuik总组蛋白提取HT试剂盒

用于从培养于96孔板的哺乳动物细胞中分离组蛋白

 

2. 蛋白提取

EpiQuik核提取试剂盒可让研究人员可靠且便捷地从细胞或组织中分离核蛋白,仅需一小时。提取物可用于EpiGentek的DNA甲基转移酶(DNMT)、组蛋白甲基转移酶(HMT)、组蛋白去甲基化酶、组蛋白去乙酰化酶(HDAC)和组蛋白乙酰转移酶(HAT)试剂盒,或用于多种应用,包括Western blot、蛋白-DNA结合分析、核酶分析以及任何需要优化核蛋白的程序。

编号

名称

描述

OP-0002

EpiQuik核提取试剂盒

用于从细胞或组织中分离和提取核蛋白,保持酶活性

OP-0022

EpiQuik核提取试剂盒II(无核酸)

用于从细胞或组织中分离无核酸的核蛋白,保持酶活性

 

3. 组蛋白H3和H4多重分析

通过EpiQuik组蛋白H3和H4修饰多重分析试剂盒,您可以全面了解样本的组蛋白修饰状态。这种类似ELISA的方法仅需标准微孔板读取器。通过同时测量21种不同的组蛋白H3修饰、10种不同的组蛋白H4修饰或22种不同的循环组蛋白H3修饰,节省时间和成本。这些试剂盒包含了所有最重要且经过良好表征的模式。

编号

名称

描述

P-3100

EpiQuik组蛋白H3修饰多重分析试剂盒

组蛋白提取物,21种不同的组蛋白H3修饰

P-3102

EpiQuik组蛋白H4修饰多重分析试剂盒

组蛋白提取物,10种不同的组蛋白H4修饰

P-3106

EpiQuik循环修饰组蛋白H3多重分析试剂盒

血清/血浆样本,定量22种不同的循环组蛋白H3修饰

 

4. 组蛋白定量

定量组蛋白甲基化或乙酰化对于研究基因表达模式特别有用。EpiGentek提供了一系列完整的类似ELISA的试剂盒,用于定量H3或H4在特定赖氨酸上的甲基化或乙酰化,包括比色和荧光版本。

 

组蛋白H3和H4甲基化定量试剂盒包括: (*荧光版本)

组蛋白 货号 组蛋白 货号 组蛋白 货号 组蛋白 货号
H3K4me1 P-3024 H3K9me3 P-3034 H3K36me1 P-3046 H3K79me3 P-3058
H3K4me1* P-3025 H3K9me3* P-3035 H3K36me1* P-3047 H3K79me3* P-3059
H3K4me2 P-3022 H3K9Pan P-3036 H3K36me2 P-3048 H3K79Pan P-3060
H3K4me2* P-3023 H3K9Pan* P-3037 H3K36me2* P-3049 H3K79Pan* P-3061
H3K4me3 P-3026 H3K27me1 P-3038 H3K36me3 P-3050 H4K20me1 P-3064
H3K4me3* P-3027 H3K27me1* P-3039 H3K36me3* P-3051 H4K20me1* P-3065
H3K4Pan P-3028 H3K27me2 P-3040 H3K36Pan P-3052 H4K20me2 P-3066
H3K4Pan* P-3029 H3K27me2* P-3041 H3K36Pan* P-3053 H4K20me2* P-3067
H3K9me1 P-3030 H3K27me3 P-3042 H3K79me1 P-3054 H4K20me3 P-3068
H3K9me1* P-3031 H3K27me3* P-3043 H3K79me1* P-3055 H4K20me3* P-3069
H3K9me2 P-3032 H3K27Pan P-3044 H3K79me2 P-3056 H4K20Pan P-3070
H3K9me2* P-3033 H3K27Pan* P-3045 H3K79me2* P-3057 H4K20Pan* P-3071

组蛋白H3和H4乙酰化定量试剂盒包括: (*荧光版本) 

组蛋白 货号 组蛋白 货号 组蛋白 货号 组蛋白 货号
H3K9ac P-4010 H3K18ac* P-4015 H3K56ac* P-4021 H4K12ac P-4028
H3K9ac* P-4011 H3K27ac P-4059 H4K5ac P-4022 H4K12ac* P-4029
H3K14ac P-4012 H3K36ac P-4018 H4K5ac* P-4023 H4K16ac P-4026
H3K14ac* P-4013 H3K36ac* P-4019 H4K8ac P-4024 H4K16ac* P-4027
H3K18ac P-4014 H3K56ac P-4020 H4K8ac* P-4025


更多组蛋白H3和H4甲基化或乙酰化定量试剂盒,欢迎垂询Epigentek中国区独家代理,艾美捷科技


5. 组蛋白乙酰转移酶(HAT)和组蛋白去乙酰化酶(HDAC)

蛋白质乙酰化和去乙酰化之间的平衡控制着多种生理和病理细胞过程。研究维持这种平衡的酶——组蛋白乙酰转移酶(HATs)和组蛋白去乙酰化酶(HDACs)。我们有试剂盒可以快速测量HAT活性或定量整个HDAC家族(1-11)的成员。

编号 名称 描述
P-4003 EpiQuik HAT活性/抑制分析试剂盒 安全且快速地测量组蛋白乙酰转移酶活性/抑制
P-4034 P-4035* Epigenase HDAC活性/抑制直接分析试剂盒 (*荧光版本) 测量核提取物或纯化的HDAC同工型(HDACs 1-11)中HDAC酶的总活性/抑制
查看编号 EpiQuik HDAC1 -7分析试剂盒 通过类似ELISA的方法定量测量HDAC 1-11蛋白的总量

6. 组蛋白甲基转移酶(HMT)和去甲基化酶

赖氨酸甲基化标记组蛋白尾部和球状域的多个位置,其水平由甲基转移酶(“书写者”)和去甲基化酶(“擦除者”)特异性平衡。使用我们便捷的类似ELISA的分析方法,直接测量HMT或组蛋白去甲基化酶的活性水平,研究组蛋白甲基转移酶(HMT)或去甲基化酶的功能。

 

组蛋白甲基转移酶(HMT)分析包括:

编号 名称 描述
P-3002 EpiQuik组蛋白甲基转移酶活性/抑制分析试剂盒(H3K4) 测量特异性靶向组蛋白H3赖氨酸4的HMT活性
P-3003 EpiQuik组蛋白甲基转移酶活性/抑制分析试剂盒(H3K9) 测量特异性靶向组蛋白H3赖氨酸9的HMT活性
P-3005 EpiQuik组蛋白甲基转移酶活性/抑制分析试剂盒(H3K27) 测量特异性靶向组蛋白H3赖氨酸27的HMT活性
P-3088 Epigenase PRMT甲基转移酶(II型特异性)活性/抑制分析试剂盒 使用核提取物或纯化酶测量总II型PRMT活性


组蛋白去甲基化酶分析包括: (*荧光版本)

编号 名称 描述
P-3078 P-3079* Epigenase LSD1去甲基化酶活性/抑制分析试剂盒 通过直接检测LSD1转化的去甲基化产物测量LSD1活性
P-3080 P-3081* Epigenase JMJD2去甲基化酶活性/抑制分析试剂盒 通过直接检测JMJD2转化的去甲基化产物测量JMJD2活性
P-3082 P-3083* Epigenase JARID去甲基化酶活性/抑制分析试剂盒 通过直接检测JARID转化的去甲基化产物测量JARID活性
P-3084 P-3085* Epigenase JMJD3/UTX去甲基化酶活性/抑制分析试剂盒 通过直接检测JMJD3/UTX转化的去甲基化产物测量JMJD3或UTX活性


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