非变性2D-PAGE:两向均在非变性条件下进行,这样分离的蛋白质点的等电点和表观分子 量同生理条件下获得的这些蛋白的值是一样的;
非变性/SDS-2D-PAGE:第一向采用非变性IEF,之后在2%SDS溶液中平衡;第二向也在SDS存在的条件下进行.适于分析非共价键连接的蛋白-蛋白间的相互作用.
非变性/还原/SDS-2D-PAGE:非变性条件下IEF聚焦,之后用8M尿素+5%β-ME+2%SDS进行平衡,再进行第二向SDS-PAG电泳.此 时分离的蛋白质点可进行点的切取、蛋白酶消化、MALDI-TOF-MS分析鉴定,提供关于断裂二硫键连接的多肽的信息.
变性2D-PAGE:样品先用2%SDS+5%β-ME+95℃变性5min,IEF在8M尿素+1%NP-40条件下进行,之后胶条用2%SDS+5%β-ME平衡,然后进行SDS-PAGE .该技术适于DNA序列和多肽结构的分析,或分析被碳氢键连接和其它翻译后修饰所引起的多肽结构微异质性,但此方式显示的大于100Kd 的蛋白质点少于第三种方式.
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