简介多序列比对的目的是发现多条序列的共性，对于研究分子结构、功能及进化关系极为有用。目前的方法还在不断地发展中，大多数算法都是基于渐进的比对的思想，在序列两两比对的...
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植物分子标记及应用-简单序列重复标记
简介分子标记（molecular marker）是遗传标记（genetic marker）的一种，是在基因水平上的标记，直接在 DNA 分子上检测遗传变异，用作指示...
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DNA 序列测定——化学(Maxam-Gilbert) 测序法
在Maxam 和Gilbert 发展的DNA 化学测序法(1977, 1980) 中，碱基专一性化学试剂在一种或两种特定核苷酸位置上随机断裂已纯化的3’端或5′ 端...
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DNA 序列测定——双脱氧( Sanger ) 测序法
双脱氧法或酶法利用DNA 聚合酶合成单链DNA 模板的互补拷贝，这一方法最先由F. Sanger 及其合作者发展而来。DNA 聚合酶不能起始DNA 链的合成，而是在...
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ChIP实验中引物序列的选择策略
一、基于目标基因启动子区域的设计ChIP实验主要检测转录因子与基因启动子区的结合情况，因此引物设计应优先选择目的基因的启动子区域。启动子区域通常位于转录起始位点上游...
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增强子及超级增强子序列查找
一、什么是增强子？增强子是指能够增加启动子活性,从而增加基因转录效率的DNA序列。增强子分为细胞特异性增强子和诱导性增强子两种类型：细胞特异性增强子是在特定的细胞或...
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解锁shRNA序列设计的秘密【提升实验成功率】
一、明确设计目标首先，明确你的实验目标，即确定你想要沉默的目标基因。了解目标基因的功能和表达模式，有助于你更准确地设计shRNA序列。二、设计原则①特异性：确保...
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构建shRNA序列设计流程
一、目标基因选择与shRNA设计①明确目标基因：确定需要调控的目标基因及其在细胞或组织中的功能。②选择靶序列：利用在线工具（如RNAi Design Too...
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最新shRNA序列设计趋势与策略
一、shRNA序列设计原则①发夹结构：shRNA包括两个短反向重复序列，中间由一茎环（loop）序列分隔，组成发夹结构。这种结构是shRNA发挥作用的基础。②...
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shRNA序列设计实战技巧：优化基因表达调控
一、靶点选择与评估㈠特异性评估：①选择与目标基因mRNA序列高度特异且避免与其他基因同源的靶点。②利用生物信息学工具（如BLAST）进行序列比对，评估靶点的特异性...
