SDS-PAGE(十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳)是一种基于大小分离蛋白质的常用技术。通过使蛋白质变性并赋予其均匀的负电荷,在电场作用下蛋白质向正极迁移,根据大小进行分离。本文将详细介绍SDS-PAGE凝胶的配制方法及常见问题和解决对策。一、SDS-PAGE凝胶配制*注意事项:丙烯酰胺和双丙烯酰胺是神经毒素,操作时应佩戴适当的个人防护装备。总体积通常为10 mL,但可以根据需要调整。过硫酸铵(APS)作为引发剂,与TEMED一起使用可以加速聚合反应。缓冲液的体积会根据丙烯酰胺和双丙烯酰胺的体积进行调整,以确保总体积的准确性。这些配方是基于常用的分离胶浓度,具体实验可能需要根据目标蛋白质的分子量范围进行调整。1.分离胶配制(1)配方表:以下表格列出了不同浓度的分离胶的配方:
凝胶浓度 (%) | 水 (mL) | 30% 丙烯酰胺(mL) | 1.5 M Tris-HCl (pH 8.8) (mL) | 10% SDS (µL) | 10% APS (µL) | TEMED(µL) |
6% | 3.3 | 2 | 1 | 50 | 50 | 5 |
8% | 4.6 | 2.6 | 1 | 100 | 100 | 10 |
10% | 3.8 | 3.4 | 1 | 100 | 100 | 10 |
12% | 3.2 | 4 | 1 | 100 | 100 | 10 |
15% | 2.2 | 5 | 1 | 100 | 100 | 10 |
(2)配制步骤:1. 清洁玻璃板和垫片:• 使用去离子水和乙醇彻底清洁玻璃板和垫片,确保没有残留物。2. 组装玻璃板:• 使用垫片将玻璃板组装在稳定、均匀的表面上,确保组装紧锁夹子,检查玻璃板完好性。3. 配制分离胶溶液:• 在干燥、干净的烧杯中按照配方表中的比例混合水、30%丙烯酰胺、1.5 M Tris-HCl (pH 8.8)、10% SDS、10% APS 和 TEMED。TEMED必须是最后 加入的成分。• 搅拌均匀后,立即倒入组装好的玻璃板中,确保均匀分布。• 用水或异丙醇覆盖凝胶表面,以保持均匀的表面,室温下凝固约 20-30 分钟。2.浓缩胶配制(1)配方表:以下表格列出了浓缩胶的配方:
凝胶浓度 (%) | 水 (mL) | 30% 丙烯酰胺 (mL) | 0.5 M Tris-HCl (pH 6.8) (mL) | 10% SDS (µL) | 10% APS (µL) | TEMED (µL) |
4% | 6.14 | 1.06 | 3.3 | 100 | 100 | 10 |
5% | 5.86 | 1.34 | 2.6 | 100 | 100 | 10 |
6% | 5.28 | 1.72 | 3 | 100 | 100 | 10 |
(2)配制步骤:1. 清洁玻璃板和垫片:• 使用去离子水和乙醇彻底清洁玻璃板和垫片,确保没有残留物。2. 组装玻璃板:• 使用垫片将玻璃板组装在稳定、均匀的表面上,确保组装紧锁夹子,检查玻璃板完好性。3. 配制浓缩胶溶液:• 在干燥、干净的烧杯中按照配方表中的比例混合水、30%丙烯酰胺、0.5 M Tris-HCl (pH 6.8)、10% SDS、10% APS 和 TEMED。TEMED必须是最 后加入的成分。• 搅拌均匀后,立即倒入组装好的玻璃板中,确保均匀分布。• 用水或异丙醇覆盖凝胶表面,以保持均匀的表面,室温下凝固约 20-30 分钟。
二、可能出现的问题及解决方案在SDS-PAGE凝胶制备过程中,可能会遇到各种问题。以下是一些常见问题及其解决方案:1. 漏胶问题:• 原因:玻璃板未对齐或缺损,垫片密闭性不良。• 解决方案:确保玻璃板干燥,对齐后紧锁夹子,检查玻璃板完好性。2. 凝胶不凝固:• 原因:APS或TEMED失效,操作不当。• 解决方案:使用新鲜APS,确保TEMED未变质,避免胶未凝固前晃动。3. 凝胶凝固不均匀:• 原因:玻璃板未洗净,试剂有沉淀,混合不均匀。• 解决方案:彻底清洗玻璃板,确保试剂澄清透明,均匀混合组分。4. 凝胶中有气泡:• 原因:胶垫材质问题,插梳子不当。• 解决方案:使用实心软胶垫或保鲜膜,正确插入梳子。5. 上层胶边缘缺损:• 原因:玻璃板边条密闭性不良。• 解决方案:检查并更换边条,确保其密闭性。6. 拔梳子后泳道有胶丝:• 原因:TEMED 用量过多。• 解决方案:减少TEMED用量,确保在插梳子前胶未部分凝固。7. 拔梳子后泳道歪斜:• 原因:梳子与玻璃板不匹配。• 解决方案:确保梳子与玻璃板匹配,必要时更换。8. 上层胶中电泳出现“漏样”:• 原因:玻璃板与胶局部分离,上样缓冲液问题。• 解决方案:小心取下玻璃板,避免分离,上样时避免枪头插得太深。9. 泳道中心凹陷:• 原因:梳子插入后胶暴露于空气中时间过长。• 解决方案:尽量在 25 分钟内插入梳子,避免长时间暴露。结语通过详细了解SDS-PAGE凝胶的配制方法及常见问题的解决方案,实验者可以有效提高实验成功率,减少误操作,从而获得高质量的实验结果。一块优质的SDS-PAGE胶能打好蛋白质电泳的基础,从而跑出清晰好看的条带,获得优质的实验结果。
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