标题：Reduced H3K27me3 leads to abnormal Hox gene expression in neural tube defects.
PMID: 31856916 PMCID: PMC6921514 DOI: 10.1186/s13072-019-0318-1
背景：
神经管缺陷 （NTD） 是严重的常见出生缺陷，是由于早期胚胎发生过程中正常神经管闭合失败所致。越来越多的有力证据表明，遗传因素是导致 NTDs 病因的原因，其中 HOX 基因在神经管闭合中起关键作用。尽管 HOX 基因表达异常可导致 NTD，但其潜在的病理机制尚未完全了解。
方法：
我们使用 RNA 测序和染色质免疫沉淀测序测定在 E8.5 、 E9.5 和 E10.5 上检测到 H3K27me3 和 Hox 基因在视黄酸 （RA） 模型中的表达诱导小鼠 NTDs。此外，我们使用 NanoString nCounter 定量了 39 例 NTD 患者胎儿脑组织中的 10 个 Hox 基因，包括无脑畸形、脊柱裂、脑积水和脑膨出。
结果：
在这里，研究人员结果显示 26 个基因的差异表达，表达水平> 20 倍变化，包括 10 个上调的 Hox 基因。RT-qPCR 显示这 10 个 Hox 基因在 RA 诱导的小鼠 NTD 以及 RA 处理的胚胎干细胞 （ESCs） 中均上调。使用 ChIP-seq 测定，我们证明 H3K27me3 水平的降低上调了 E10.5 上 RA 诱导的小鼠 NTDs 模型中 Hox 簇 A-D 的表达。有趣的是，由于 UTX 和 Suz12 之间的合作，RA 处理导致 H3K27me3 衰减，影响 Hox 基因调控。进一步分析，在人类无脑畸形病例中，观察到 10 个 HOX 基因的上调，以及 H3K27me3 的异常水平。值得注意的是，HOXB4 、 HOXC4 和 HOXD1 表达与 H3K27me3 水平呈负相关。
结论：
结果表明异常的 H3K27me3 水平诱导的异常 HOX 基因表达可能是 NTD 的危险因素，并强调了进一步分析 NTD 全基因组表观遗传修饰的必要性。
使用产品：
| 产品名称 | 货号 | 规格 | 研究领域 |
| 表观酶? JMJD3/UTX去甲基化酶活性/抑制检测试剂盒（比色法） Epigenase JMJD3/UTX Demethylase Activity/Inhibition Assay Kit (Colorimetric) |
P-3084-48 P-3084-96 |
48 次检测 96 次检测 |
组蛋白甲基化 |
部分发表文献：
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