材料与仪器
PCR 缓冲液 ddH20 基因组 DNA dNTP 寡核苷酸引物离心机和转子 丙烯酸防护板 过滤阻挡吸头 多道移液器 PCR 仪 托盘 固定器装置 底座管盖小管
步骤
一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂含 15 mmol/LMgCl2的 10XPCR 缓冲液 (GeneAmpPCR 缓冲液 I,AppliedBiosystems)灭过菌的 ddH202. 酶和酶缓冲液TaqDNA 聚合酶,(AppliedBiosystems 或 Invitrogen)3. 核酸和寡核苷酸基因组 DNA10 mmol/L dNTP(GeneAmpPCRdNTP 混合物,AppliedBiosystems)寡核苷酸引物(Invitrogen 公司合成,稀释成 lOumol/L)4. 离心机和转子用翻转吊桶式转子和微板适配器离心5. 专用设备丙烯酸防护板(acrylicshield)过滤阻挡吸头(filterbarriertips)多道移液器(Eppendorf 或 ApogentDiscoveries)PCR 仪,96 孔(AppliedBiosystemsGeneAmp9700)托盘/固定器装置和底座,96 孔(AppliedBiosystems)管盖,一条 8 个(USAScientific 或 AppliedBiosystems)小管,0.2 ml,一条 8 个(USAScientific 或 AppliedBiosystems)二、方法1. 在冰上融化 dNTP、10XPCR 缓冲液和未标记的引物。Taq 酶在加入反应混合物之前应保存在-20°C。在丙烯酸防护板后融化标记的引物。2. 每一个反应的混合物包括:灭菌 ddH20 6.95ul含 MgCl2的 10XPCR 缓冲液 1.25ul10mmol/LdNTP 0.25ul10mmol/L 未标记引物 0.5ul标记引物 0.5ul在优化实验条件过程中,如果 PCR 产物的放射信号强度太低,可以增加标记引物的用量,同时按相应比例调整 ddH20 的体积。TaqDNA 聚合酶(终浓度为 0.25U) 0.05ul对于一个 96 孔微孔板,准备用于 100 个反应的混合物。3. 混匀,按等份加入放置在冰上的 PCR 板中(9.5ul/样品)。4. 用多道移液器加入 3ulDNA(60ng),混匀。5. 把盖子盖紧,将板放入预热到 94°C 的 PCR 仪中。6. 如果产物大小是 200bp, 扩增 30 个循环。循环参数如下:94°C 初始变性 5 min;30个循环的 94°C 变性 30s; 根据经验确定的退火温度(Tm) 退火 30s;72°C 延伸 30s。最后一步 72°C 延伸 7 min。值可以通过引物序列计算出来,公式为 2(A+T)+4(G+C)。7. 扩增完成后,将样品于-20°C 冻存,或者直接进入方案 3。
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