菌落PCR,快速鉴定重组质粒

质粒快速鉴定

试剂:

Protoplasting buffer:

30mM Tris-HCl, pH8.0 0.33ml/1.0M

5mM EDTA 0.1ml/0.5M

50mM NaCl 0.1ml/5.0M

20% Sucrose 5ml/40%

50 µ g/ml RNAseI 50ul/10mg/ml

50 µ g/ml lysozyme 50ul/10mg/ml

补水至10ml,-20℃分装保存。

Lysis buffer:

89mM Tris-HCl, pH8.0

89mM boric acid 2ml of 5×TBE

2.5mM EDTA

2% SDS 2ml of 10%

5% sucrose 1.25ml of 40%

0.04% bromphenol blue 4mg

补水至 10ml , - 20℃分装保存。

步骤:

1 .将转化后的菌液铺平板, 37 ℃ 过夜培养。

2 .配制 0 .6--0 .7% 的琼脂糖 TBE 胶。

3 .用连续加样枪在 96 孔板中每孔加入 10 µ l Photo plasting Buffer 。

4 .用灭过菌的 10ul 小枪头挑取单克隆白斑至含有 Photo plasting Buffer 的 96 孔板中,振荡混匀。

5 .用连续加样枪将 Lysis Buffer 上样于凝胶中,每孔 4 µ l ,用排枪将细胞与 Protoplasting buffer 混合液 上样于凝胶中(细胞在 Protoplasting buffer 中不宜超过 30-40 min ),并点上 Marker 。

6 .调节电压为 20V (小槽)或 40V (大槽),电泳 15min ,使细胞充分裂解,将电压调高到 200V ,继续电泳 1hr ,照相。

7 .根据胶图粗略鉴定插入片段的大小及小片段率。

2.菌落PCR

1.取适量PCR薄壁管,置于冰上,每管先加入17.3ul的灭菌水。

2.用灭过菌的10ul小枪头挑取单克隆白斑至灭菌水中, 振荡混匀。

3.依次加入:

10xbuffer 2.5

Mgcl2 (25mM) 1.8

DNTP(2.5mM) 1

T3 引物(10pmol) 1

T7 引物(10pmol) 1

Taq酶 0.4

total 25ul

各试剂均加好后,离心机上甩一下,使之沉底,置于PCR仪上

4.94℃,2min。

5. 94℃ 4分钟

94℃ 40秒

53.6℃ 40秒 35个循环

72℃ 4分钟

72℃ 10分钟

4℃ 24小时

6.待PCR反应进入4℃后,取下PCR薄壁管,取7ulPCR产物加入3ul溴芬兰跑电泳,同时上1Kb DNA ladder。半小时后照相,观察胶图, 根据胶图粗略鉴定插入片段的大小及小片段率。

7.将快速鉴定和菌落PCR检测合格的文库送检。

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