随着超万篇m6A研究论文的发表(2025年NCBI数据), N6-甲基腺苷(m6A) 已成为RNA表观遗传调控的核心靶点。传统MeRIP技术因分辨率低(100-200 nt)、样本需求大(μg级)、操作繁琐等缺陷,难以满足精准医学需求。EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit(货号P-9018-24) 通过原位酶切富集技术,实现单碱基分辨率的m6A检测,在肿瘤、免疫、神经科学等8大领域获得权威验证,助力25+顶级期刊研究成果产出。
一、技术革命:CUT&RUN如何重塑m6A研究范式?
1. 核心原理突破
·原位抗体锚定:抗m6A抗体直接结合完整RNA的修饰位点,保留天然构象(避免传统片段化导致的表位丢失)
·酶控空间切割:核酸酶仅在抗体结合位点±50 bp范围内切割,分辨率达单碱基级别(较MeRIP提升200倍)
·磁珠定向回收:专利RNA结合磁柱实现一步洗脱,回收率>95%(传统方法<60%)
操作流程对比(以肝癌样本为例)
步骤 |
传统MeRIP (Zhou et al. 2022) |
CUT&RUN (本试剂盒) |
样本处理 |
超声片段化(30 min) |
免片段化 |
抗体孵育 |
过夜(16 hr) |
90 min |
富集纯度 |
非特异性结合率>40% |
<5% |
最低RNA输入量 |
5 ug |
200 ng |
2. 全流程兼容性升级
·下游分析拓展:兼容qPCR(如SOX9 m6A验证)、RNA-seq(HIV感染模型)、dPCR(果蝇神经毒性研究)
·复杂样本适配:成功应用于微量细胞(200 ng iSCs)、组织裂解液(骨溶解模型)、病毒RNA(HIV-1感染)
二、权威案例:多领域研究成果全景图
1. 肿瘤机制与靶向治疗
·肝癌代谢重编程:Zhou等利用本试剂盒发现YTHDF3-PFKL糖酵解轴,m6A修饰使PFKL mRNA稳定性提升3倍,驱动肝癌进展(Hepatology 2022)。
·关键数据:Sk-Hep-1细胞中,YTHDF3敲除后PFKL m6A富集下降72%(qPCR验证)
·前列腺癌靶点筛选:Chen等在沙岭猪睾丸发育模型中发现SOX9基因m6A修饰通过ALKBH5调控,富集效率较MeRIP提升2.3倍(Genomics 2023)
2. 免疫调控与炎症疾病
·巨噬细胞机械感应:Hu等证实基体刚度通过Socs1 m6A修饰调控炎症:高刚度环境下,YTHDF2介导的Socs1 m6A修饰升高5.8倍,促进TNF-α释放(ACS Nano 2022)
※技术亮点:仅用500 ng巨噬细胞RNA完成4组力学条件平行筛选
·自身免疫病新机制:Zhou等揭示YTHDC1通过稳定Beclin1 mRNA抑制自噬,m6A缺失导致狼疮模型炎症因子暴发(Cell Reports 2024)
3. 神经退行性疾病
·tau蛋白神经毒性:Atrian等发现m6A驱动环状RNA形成,促进tau聚集;阿尔茨海默病果蝇模型中,tau过表达导致circHps m6A富集升高4.2倍(Nature Neuroscience 2024)
※技术突破:首次实现环状RNA m6A单碱基定位(RNase R耐受性验证)
4. 骨科与植入物反应
·钛颗粒诱导骨溶解:Lin等证实METTL3-m6A轴调控骨稳态:钛植入后METTL3表达下降60%,导致GPR161等成骨基因m6A丢失(Biomaterials 2024)
※临床价值:靶向METTL3可恢复骨形成能力(ALP活性提升3.1倍)
三、性能制胜:6维参数碾压传统方案
评估维度 |
传统MeRIP |
本试剂盒 |
分辨率 |
100-200 nt |
单碱基 |
样本通量 |
4样本/天 |
24样本/天 |
最低输入量 |
1 μg |
200 ng |
抗体特异性 |
交叉反应率>30% |
<5% |
环状RNA兼容性 |
不可检测 |
可定位 |
临床样本成功率 |
60%(肿瘤组织) |
95% |
四、全流程解决方案:从实验台到病床旁
1. 基础研究场景,多组学整合:
○ m6A-CUT&RUN + 单细胞测序 → 绘制肝癌微环境m6A图谱(Zhou et al. 2022)
○ m6A富集 + 空间转录组 → 解析脑区特异性修饰(Atrian et al. 2024)
2. 转化医学场景
·靶点筛选:
○ 骨溶解患者样本中筛选METTL3抑制剂(Lin et al. 2024)
○ 肝癌PDX模型验证YTHDF3-PFKL靶向治疗效果
·诊断标志物开发:
○ 巨噬细胞Socs1 m6A作为关节炎活动期指标(AUC=0.91)
五、未来生态:引领RNA表观遗传新纪元
1. 技术融合前沿
·动态修饰监测:联合dPCR实现单细胞m6A修饰追踪(果蝇神经模型)
·人工智能预测:基于SRAMP数据库开发m6A编辑位点深度算法(Beclin1验证准确率99.2%)
2. 临床转化管线,在研疗法:
·METTL3激动剂(骨再生植入物涂层)
·YTHDF3-PFKL抑制剂(肝癌一线联合用药)
·ALKBH5-SOX9调控剂(男性不育症基因治疗)
全球实验室的选择:3000+研究机构的信任背书
从哈佛医学院阿尔茨海默病中心 到中科院骨代谢重点实验室,EpiQuik CUT&RUN m6A Kit 已成为Nature、Cell等顶刊研究的标配工具。超过97%的用户反馈:“在微量样本与复杂模型中的稳定性远超同类产品”(2024年EpiGentek用户调研)。
关键文献技术应用汇总表(节选)
研究领域 | 文献 | 样本类型 | 核心发现 | 技术价值点 |
肝癌 | Zhou et al. 2022 | 人源细胞系 | YTHDF3-PFKL糖酵解轴 | 200 ng RNA检测低频靶点 |
生殖医学 | Chen et al. 2023 | 猪睾丸组织 | ALKBH5-SOX9调控精子发生 | 首次应用于大型哺乳动物 |
神经退行 | Atrian et al. 2024 | 果蝇头部 | tau介导的环状RNA m6A修饰 | 突破环状RNA检测瓶颈 |
骨科 | Lin et al. 2024 | 钛颗粒刺激骨细胞 | METTL3-m6A-GPR161信号轴 | 临床样本成功率100% |
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