从石蜡包埋固定的组织中制备 RNA 实验

材料与仪器

石蜡包埋的组织样品甲酰胺 消化缓冲液 乙醇 肝糖 异丙醇 苯酚 氯仿 蛋白酶 K Trizol 二甲苯微量离心管 恒温箱

步骤

一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去离子化的甲酰胺焦碳酸二乙酯(DEPC) 处理过的水消化缓冲液(lmol/L 异硫氰酸胍,25 mmol/Lβ-巯基乙醇,0.5%N-月桂酰肌氨酸,20 mmol/LTris-HCl,pH7.5)乙醇,100% 和 70%肝糖异丙醇苯酚 (pH4.3): 氯仿(70%:30%)蛋白酶 K(60 mg/ml,20U/mg)Trizol(Invitrogen)二甲苯2. 特殊设备微量离心管,2 ml, 无 RNA 酶恒温箱,预调至 37°C水浴或恒温箱,预调至 55°C3. 细胞和组织石蜡包埋的组织样品,切割为 5~50 张 5um 厚的切片二、方法1. 将组织块置于 2.0 ml 微量离心管中,向样品中加 1.8 ml 二甲苯。37°C 温育 20 min。2. 稍微地离心样品,移弃上清液再加入二甲苯,重复温育和离心步骤。3. 用 0.5 ml 乙酵洗涤组织。移弃乙醇,风干。4. 加 80ul 蛋白酶 K(60 mg/ml,20U/mg) 和 72ul 消化缓冲液。55°C 下振荡温育过夜。5. 再次加 80ul 蛋白酶 K,55°C 下振荡温育过夜。次日再次加 80ul 蛋白酶 K, 再次 55°C下振荡温育过夜。6. 加等体积酚:氯仿,混合,在微量离心机中以最大转速离心 5 min。将液相转移到RNA 酶的新管中。7. 加等体积异丙醇和 2ug 肝糖,-20°C 放置 30 min。8. 在微董离心机中以最大转速离心 30 min。移弃上清液,用 70% 乙酵洗涤沉降物。9. 在微量离心机中以最大转速离心 30 min 并移弃上清液。风干沉降物,将之再溶解20ulDEPC 处理过的水中。加 500ulTrizol。遵循 Trizol 方案(见本章方案 3),对一处做修改:在第一次 Trizol 处理后,将液相转移到无 RNA 酶的新管中,用 500ulTrizol 第二次处理样品。10. 向第二次 Trizol 处理过的液相加 500ul 异丙醇以沉淀 RNA。11. 将 RNA 沉降物再溶解于 20ul 去离子甲酰胺中。-20°C 储存 RNA。

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