当细胞被裂解，内容物释放时，蛋白水解酶和其他一些降解的酶也一同被释放，这时候需要在裂解的缓冲液中加入蛋白水解酶。PS: 细胞自己的蛋白水解酶也会降解细胞内的蛋白质。
| 抑制剂 | 靶向的蛋白酶 | 有效浓度 | 储存浓度 | 其他 |
| 抑蛋白酶肽 | 丝氨酸蛋白水解酶 | 0.1-2ug/ml | 10mg/ml溶解在PBS中 | 避免反复冻融 |
| EDTA | 金属蛋白水解酶 | 0.5-2mmol/L | 500mmol/L pH8.0水溶液 | |
| 亮抑酶肽 | 丝氨酸和苏氨酸蛋白水解酶 | 0.5-2ug/ml | 10mg/ml水溶液 | |
| α巨嗜球蛋白 | 广谱 | 1单位/ml | 100单位/ml溶解在PBS中 | 避免还原性试剂 |
| 抑胃酶肽 | 酸性蛋白水解酶 | 1ug/ml | 1mg/ml溶在甲醇中 | |
| 苯甲基磺酰氟 | 丝氨酸蛋白水解酶 | 20-100ug/ml | 10mg/ml溶在异丙醇中 | 现配现用 |
| 甲苯磺酰异亮氨酰氯甲酮 | 胰岛素 | 50ug/ml | 1mg/ml溶在50mmol/L的乙酸中，pH5.0 | 胰凝乳蛋白酶不受影响 |
| 甲苯磺酰苯丙氨酰氯甲酮 | 胰凝乳蛋白酶 | 100ug/ml | 3mg/ml溶在乙醇中 | 胰岛素不受影响 |
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